Premio Emprendedor del Año a la Innovación 2006, concedido por Ernst&Young, en colaboración con la escuela de negocios IESE, el Grupo Vocento y Fortis, a Jorge Sendagorta, presidente de SENER.

Premio Made in Euskadi 2006, entregado por la Fundación Empresa Vasca y Comunicación a SENER en reconocimiento a la labor desarrollada por la empresa en el mercado internacional a lo largo de sus 50 años de historia.